MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 12268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020557	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020557	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020557	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020557	G	7	7	306	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020557	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020557	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020557	T	6	6	1804	1809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020557	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020557	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020557	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020557	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020557	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020557	T	7	7	4504	4510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020557	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020557	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_020557	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020557	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020557	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020557	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020557	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020557	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020557	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020557	T	7	7	10643	10649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020557	A	6	6	10656	10661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020557	A	6	6	10706	10711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020557	A	7	7	12655	12661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020557	TAA	2	6	12668	12673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020557	A	6	6	12684	12689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020557	TAT	2	6	12718	12723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020557	AGT	2	6	15713	15718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020557	T	7	7	15743	15749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020557	AT	3	6	15808	15813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020557	A	6	6	15896	15901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020557	T	7	7	15911	15917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020557	T	6	6	15941	15946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020557	CTT	2	6	15971	15976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020557	A	7	7	16803	16809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020557	TTG	2	6	16834	16839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020557	AGC	2	6	16844	16849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020557	G	6	6	17139	17144	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020557	T	7	7	20113	20119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020557	CTC	2	6	21237	21242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_020557	T	6	6	21305	21310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020557	A	7	7	21367	21373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020557	ATT	2	6	21379	21384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020557	GAG	2	6	21441	21446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020557	TCA	2	6	22911	22916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020557	A	6	6	23926	23931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020557	CG	3	6	23970	23975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020557	AAG	2	6	25650	25655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020557	GGA	2	6	27285	27290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020557	T	6	6	28041	28046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020557	AAAT	2	8	28709	28716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020557	A	7	7	28724	28730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020557	AT	3	6	28756	28761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020557	TCA	2	6	28767	28772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020557	A	6	6	28873	28878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020557	AGGA	2	8	28887	28894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020557	GTC	2	6	28896	28901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020557	TAAA	2	8	30816	30823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020557	T	6	6	31876	31881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020557	T	7	7	31903	31909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020557	T	6	6	31936	31941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020557	GAAA	2	8	31958	31965	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020557	A	6	6	31974	31979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020557	A	7	7	32334	32340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020557	T	6	6	32359	32364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020557	T	6	6	32381	32386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020557	AGT	2	6	32392	32397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020557	CAT	2	6	32410	32415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020557	AGT	2	6	32420	32425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020557	T	7	7	32440	32446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020557	TCACCA	2	12	32514	32525	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020557	T	6	6	32585	32590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020557	ATT	2	6	32618	32623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020557	GAA	2	6	32631	32636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020557	TCT	2	6	32697	32702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020557	TCT	2	6	32802	32807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020557	ATA	2	6	32819	32824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020557	TGG	2	6	32825	32830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020557	GAAAA	2	10	32859	32868	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020557	ATA	2	6	32893	32898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020557	T	6	6	32929	32934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020557	TTG	2	6	32936	32941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020557	CCG	2	6	32970	32975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020557	CTT	2	6	33070	33075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020557	GTT	2	6	33082	33087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020557	T	6	6	33123	33128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020557	CCTT	2	8	33181	33188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020557	CAA	2	6	34401	34406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020557	AGG	2	6	40297	40302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020557	TCT	2	6	40313	40318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020557	A	7	7	40383	40389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020557	AAT	2	6	40405	40410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020557	ATG	2	6	40423	40428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020557	AAAT	2	8	40476	40483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020557	AGG	2	6	41538	41543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020557	AGA	2	6	41544	41549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020557	C	6	6	41569	41574	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_020557	AGG	2	6	45105	45110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020557	ATAA	2	8	47039	47046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020557	GACTT	2	10	47068	47077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_020557	TAAA	2	8	47101	47108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020557	AGTG	2	8	47118	47125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020557	T	8	8	47799	47806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020557	TC	3	6	47820	47825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020557	TTAG	2	8	47852	47859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020557	TGA	2	6	47867	47872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020557	A	6	6	49107	49112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020557	ATA	2	6	49233	49238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020557	ATT	2	6	49260	49265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020557	GCTC	2	8	49270	49277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020557	ATGGT	2	10	49320	49329	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020557	AGG	2	6	49362	49367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020557	GAG	2	6	49710	49715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020557	AGG	2	6	50293	50298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020557	T	6	6	50583	50588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020557	AAG	2	6	50627	50632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020557	TATT	2	8	50644	50651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020557	TA	3	6	50663	50668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020557	A	7	7	50674	50680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020557	T	8	8	51353	51360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020557	TAAA	2	8	51376	51383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020557	TAT	2	6	51407	51412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020557	A	6	6	51453	51458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020557	T	6	6	51474	51479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020557	TTA	2	6	51522	51527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020557	TAAAA	2	10	52359	52368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020557	GGA	2	6	52412	52417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020557	AACA	2	8	52485	52492	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020557	T	6	6	52496	52501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020557	TGCTA	2	10	52533	52542	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_020557	TTTA	2	8	52551	52558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020557	GAT	2	6	52578	52583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020557	ATTG	2	8	52590	52597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020557	AAAAAT	2	12	52621	52632	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020557	GTA	2	6	52633	52638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020557	TTA	2	6	52664	52669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020557	TACT	2	8	52673	52680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020557	TAG	2	6	52694	52699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020557	TTTTA	2	10	52701	52710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020557	ATG	2	6	52733	52738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020557	TTG	2	6	52795	52800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020557	TCT	2	6	52812	52817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020557	ATTG	2	8	52824	52831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020557	TTG	2	6	52853	52858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020557	TAT	2	6	52878	52883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020557	T	6	6	52883	52888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020557	ATAGTG	2	12	53011	53022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020557	GTT	2	6	53026	53031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_020557	GAAT	2	8	102628	102635	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
293	NC_020557	GGAG	2	8	102644	102651	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_020557	GTT	2	6	136585	136590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_020557	TTTAA	2	10	136761	136770	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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